作为一种肌肉注射药，肉毒素没有显着的副作用，比传统的手术方法具有更多优点。注入A型肉毒素后局部的不良反应主要包括咬肌过度无力及因肉毒素向临近肌肉组织扩散而引起的相应表现，而这些临床表现与注射部位和注射肉毒素的剂量有关。个别病人发现注射肉毒素以后有发热、不适、疲劳。一般这些临床表现为一过性的，并在数周内自行消失。